Коллекция боярышников в ботаническом саду начала создаваться с интродукции в начале 40-х годов XX века дальневосточных видов Боярышника Максимовича (Crataegus maximowiczii) и Б. зеленомясого (C. chlorosarca) и североамериканских видов Боярышника Дугласа (C. douglasii) и Б. крупноколючкового (C. macracantha). С начала 60-х годов было интродуцировано более 20 новых видов. Еще 10 видов были интродуцированы в 80-х годах. К настоящему времени коллекция содержит 114 образцов боярышников и 40 идентифицированных видов. Боярышники — хозяйственно-ценная группа растений. Они используются в озеленении; в качестве плодовых, особенно, североамериканские крупноплодные виды серий Coccineae и Molles. Многие виды серий Oxyacanthae и Sanguineae являются фармакопейными, их цветки и плоды используются в качестве мягкого кардиотонического средства. Виды боярышника коллекции Ботанического сада:
- Crataegus almaatensis Pojark. (Боярышник алмаатинский)
- Crataegus arnoldiana Sarg. (Боярышник Арнольда)
- Crataegus calpodendron (Ehrh.) Medik. (Боярышник урновидный)
- Crataegus canadensis Sarg. (Боярышник канадский)
- Crataegus chlorocarpa Lenne et K.Koch (Боярышник желтоплодный)
- Crataegus chlorosarca Maxim. (Боярышник зеленомясый)
- Crataegus collina Chapm. (Боярышник холмовой)
- Crataegus crus-galli L. (Боярышник петушья шпора)
- Crataegus densiflora Sarg. (Боярышник густоцветковый)
- Crataegus douglasii Lindl. (Боярышник Дугласа)
- Crataegus flabellata (Bosc ex Spach) K.Koch (Боярышник вееровидный)
- Crataegus holmesiana Ashe (Боярышник Холмса)
- Crataegus holmesiana var. amicta (Ashe) E.J. Palmer (Боярышник Холмса амикта)
- Crataegus horrida Medik. (Боярышник страшный)
- Crataegus irrasa Sarg. var. blanchardi (Sarg.) Eggl. (Боярышник Бланшара)
- Crataegus korolkovii L. Henry (Боярышник Королькова)
- Crataegus laurentiana Sarg. var. brunetiana (Sarg.) Kruschke (Боярышник лаврентийский Брюне)
- Crataegus macracantha Lodd. ex Loudon (Боярышник крупноколючковый)
- Crataegus macrosperma Ashe (Боярышник крупносемянный)
- Crataegus maximowiczii C.K.Schneid. (Боярышник Максимовича)
- Crataegus monogyna Jacq. (Боярышник однопестичный)
- Crataegus nigra Waldst. et Kit. (Боярышник черный)
- Crataegus pennsylvanica Ashe (Боярышник пенсильванский)
- Crataegus persimilis Sarg. (Боярышник схожий)
- Crataegus pringlei Sarg. (Боярышник Прингла)
- Crataegus punctata Jacq. f. aurea (Aiton) Rehder (Боярышник точечный золотистый)
- Crataegus rivularis Nutt. ex Torr. et A. Gray (Боярышник приречный)
- Crataegus russanovii Cinovskis (Боярышник Русанова)
- Crataegus sanguinea Pall. (Боярышник кроваво-красный)
- Crataegus submollis Sarg. (Боярышник мягковатый)
- Crataegus suborbiculata Sarg. (Боярышник гудзонский)
- Crataegus succulenta Schrad. ex Link (Боярышник сочный)
- Crataegus volgensis Pojark. (Боярышник волжский)